A、子弹射入木块的过程中，子弹克服阻力做功等于产生的内能和木块的动能，故A错误； BC、子弹克服阻力做的功，子弹的动能减小，一部分是转化为系统的内能，另一部分转化为木块的动能，所以子弹动能的减少量大于系统内能的增量，故B错误，C正确； D、子弹和木块相互间的作用力大小相等，可认为是恒力．但二者的位移大小不同，做功不同．故D错误； 故选：C．
